Fakultät für Mathematik und Naturwissenschaften

Professor Dr. Martin Simon

Molekulare Zellbiologie und Mikrobiologie

 

Forschung

Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit dem grundlegenden Verständnis der genetischen und epigenetischen Mechanismen durch welche Ribonucleinsäuren (RNAs) Genexpression, Entwicklung, epigenetische Vererbung und Evolution beeinflussen.

Unser Fokus liegt hierbei auf der Regulation von epigenetischen Informationen durch kleine RNAs (sRNAs). Dazu nutzen wir eine Kombination aus molekulargenetischen Methoden und Next-Generation-Sequencing (NGS), um kleine RNAs, lange RNAs und Chromatinmodifikationen genomweit zu untersuchen und Mechanismen der zellulären und systemischen Genregulation und Virusabwehr zu verstehen.
 

Publikationen

Two Piwis with Ago-like functions silence somatic genes at the chromatin level.
Drews F, Karunanithi S, Götz U, Marker S, deWijn R, Pirritano M, Rodrigues-Viana AM, Jung M, Gasparoni G, Schulz MH, Simon M
BioRxiv 2020.08.24.263970

Comparative analysis of biochemical biases by ligation- and templateswitch-based small RNA library peparation methods.
Meistertzheim M, Fehlmann T, Drews F, Pirritano M, Gasparoni G, Keller A, Simon M.
Clinical Chemistry, Volume 65, Issue 12, 1 December 2019, Pages 1581–1591

NGS analysis of total small non coding RNAs from low input RNA from dried blood sampling.
Pirritano M, Fehlmann T, Laufer T, Ludwig N, Gasparoni G, Li Y, Meese E, Keller A, Simon M.
Anal Chem. 2018 Oct 16;90(20):11791-11796.

Transgenic expression of the RNA binding protein IMP2 stabilizes miRNA targets in murine microsteatosis.
Dehghani Amirabad A, Ramasamy P, Wierz M, Nordström K, Kessler SM, Schulz MH, Simon M.
Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2018 Oct;1864(10):3099-3108.

Two sets of RNAi components are required for heterochromatin formation in trans by truncated transgenes.
Götz U, Marker S, Cheaib M, Andresen K, Shreshtha S, Durai D, Nordström K, Schulz MH, Simon M.
Nucleic Acids Research, Volume 44, Issue 12, 8 July 2016, Pages 5908–5923

weitere Publikationen

 

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