Professor Dr. Jürgen Scherkenbeck

Organische Chemie

Funktionen

Vorsitzender des Prüfungsausschusses für das Fach Chemie im Bachelor und Master of Science

Forschung

Der Schwerpunkt unserer Arbeiten liegt im Bereich der bioorganischen und medizinischen Chemie. Hierbei nutzen wir die Methoden der Organischen Chemie, um biologische Systeme besser zu verstehen und gezielt beeinflussen zu können. Umgekehrt erweitern wir durch die Beschäftigung mit "biologischen Molekülen" auch unser chemisches Verständnis.
Kennzeichnend für unser Forschungsgebiet ist das interdisziplinäre Arbeiten zwischen Chemie, Biologie und Biochemie. Üblicherweise begnügen wir uns nicht nur mit der Synthese einer neuen Substanz, sondern studieren auch ihre biologischen Effekte bzw. ihre Wechselwirkungen mit dem molekularen Target. Im Zentrum unseres Interesses stehen daher die Zusammenhänge zwischen chemischer Struktur und biologischer Wirkung.

Aktuelle Projekte umfassen unter anderem die gezielte Adressierung von onkogenen Ras-Proteinen, die an der Entstehung zahlreicher Krebserkrankungen maßgeblich beteiligt sind, mit Naturstoffen und maßgeschneiderten synthetischen Wirkstoffen.
Ein weiteres Schwerpunktprojekt beschäftigt sich mit resistenzbrechenden antibakteriellen Naturstoffen, die auf Gold Nanopartikel geladen werden und damit über einen dual-mode Wirkmechanismus verfügen. Für das Design neuer Wirkstoffe setzen wir alle aktuellen Molecular Modeling Methoden, einschließlich KI-Verfahren ein.

Publikationen

Rottlerin: Structure Modifications and KCNQ1/KCNE1 Ion Channel Activity.
M. Lübke, J.A. Schreiber, T. Le Quoc, F. Körber, J. Müller, S. Sivanathan, V. Matschke, J. Schubert, N. Strutz-Seebohm, G. Seebohm, J. Scherkenbeck
ChemMedChem 2020, 15, 1078-1088

Isolation, total synthesis and quantification of caffeoylisocitric acid, a characteristic ingredient of the superfood amaranth.
T. Zhou, B. Ringbeck, N.H. Schebb, J. Scherkenbeck
Tetrahedron 2019, 75, 4479-4485

Novel Small Molecules Antagonise the MIA Fibronectin Interaction in Malignant Melanoma.
King Tuo Yip, Xue Yin Zhong, Nadia Seibel, Stefanie Pütz, Jasmin Autzen, Raphael Gasper, Eckhard Hofmann, Jürgen Scherkenbeck, Raphael Stoll
Nature Sci. Rep. 2016, 6:25119, DOI:10.1038

Enantiomerically pure 3-aryl and 3-hetaryl-2-hydroxypropanoic acids by chemoenzymatic reduction of 2-oxo acids.
S. Sivanathan, F. Körber, J.A. Tent, S. Werner, J. Scherkenbeck
J. Org. Chem. 2015, 80, 2554–2561

Sequence-Selective Molecular Recognition of the C-Terminal CaaX-Boxes of Rheb and Related Ras-Proteins by Synthetic Receptors.
Peter M. Düppe, Thao Tran Thi Phuong, Jasmin Autzen, Miriam Schöpel, King Tuo Yip, Raphael Stoll and Jürgen Scherkenbeck
Chem. Biol. 2014, 9, 1755–1763

Structural Prerequisites for Receptor Binding of Helicokinin I, a Diuretic Insect Neuropeptide from Helicoverpa zea.
Chien Tran Van, Tino Zdobinsky, Guiscard Seebohm, Dirk Nennstiel, Oliver Zerbe, Jürgen Scherkenbeck
Eur. J. Org. Chem. 2014, 2714–2725

Bisphenol A Binds to Ras Proteins and Competes with Guanine Nucleotide Exchange: Implications for GTPase-Selective Antagonists.
M. Schöpel, K.F.G. Jockers, P.M. Düppe, J. Autzen, V.N. Potheraveedu, S.Ince, K. Tuo Yip, R. Heumann, C. Herrmann, J. Scherkenbeck, R. Stoll
J. Med. Chem. 2013, 56, 9664–9672

weitere Publikationen

Aktivitäten

Forschungsprojekte

• RIST: Ras-Inhibition in soliden Tumoren (EFRE Projekt)
• NanoComBac: Natural product - gold nanocarrier conjugates, a novel dual-mode strategy to combat resistant bacteria (BMBF Projekt)